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Autor:Córdova Santa Gadea, Jesús Humberto; Sandoval Sandoval, José Raúl; Velásquez Reinoso, Margarita Rosa Eugenia; Távara Huere, Sergia Caleen; Cotos, Desiderio; Vásquez, Jaime; Barletta Carrillo, Claudia Fiorella; Fujita Alarcón, Ricardo; Descailleaux Dulanto, Ricardo Jaime.
Título:Poblamiento del continente americano y del Perú sugerido de un análisis filogeográfico de haplogrupos del mtDNA en etnias nativas I: inferencias primarias^ies / Peopling of the American continent and Peru as suggested from a phylogeographic mtDNA haplogroups analysis in native ethnoses. I: preliminary inferences
Fuente:Arch. biol. Andina;14(1):23-39, nov. 2008. ^btab, ^bmapas.
Resumen:OBJETIVOS: Precisar el origen de las poblaciones peruanas en un contexto filogeográfico, global y temporal. METODOS: Análisis comparativo de los resultados obtenidos a partir del procesamiento del mtDNA, de cinco poblaciones peruanas nativas sitas en Pucallpa, Taquile, Anapia, Amantani y Los Uros, con los resultados obtenidos por diferentes autores en la misma molécula (reciente y antigua) de 91 etnias–localidades, que incluyen varias del continente americano y algunas de nuestro país, y 13 del SE del continente asiático. Realizamos un análisis filogeográfico a partir de las frecuencias de los haplogrupos hallados por RFLPs y una secINDEL del mtDNA. Los datos fueron procesados por el programa PHYLIP 3.65 opción Distancias de Reynolds, para determinar los valores F de Diferenciación Genética o Coalescencia. El algoritmo UPGMA usó los valores de F entre pares de ST STetnias–localidades, para construir un árbol de distancias que permita el análisis de sus principales grupamientos(clusters). RESULTADOS: El árbol obtenido exhibe 7 clusters. El cluster 1 comprende a la etnia Han ubicada al SEde Asia, en tanto que las americanas se ubican entre los clusters 2 al 7. Las etnias menos diversas fueron dos: la Quechua (Taquile, Puno-Perú) – 100 por ciento haplotipo B - y la de los Kuna (Panamá) – 100 por ciento haplotipo A-.CONCLUSIONES: Los mayores valores encontrados de diferenciación genética, corresponden a los Yanomami, con un F de 0.23741, mientras que en el Perú fueron los Quechua de Taquile con un valor F de 0.16673. En ambos casos los resultados indican, según la tabla de calificación de valores F , una Divergencia Genética Alta. (AU)^iesOBJETIVES: To determine the origins of Peruvian populations in a more global and temporal phylogeographic context. METHODS: mtDNA results obtained in our laboratories from the analysis of the mtDNA from 5 native Peruvian populations that inhabit Pucallpa, Taquile, Anapia, Amantani and Los Uros, were compared with the results obtained different authors on the same molecule from 91 ethnoses-localities that include some of our country, others from the American continent, as well as 13 of the SE of the Asian continent. Phylogeographic analysis was done from the haplogroups frequencies found from the RFLPs and an INDEL sequence of mtDNA, and the data were processed by the program PHYLIP 3.65, option Distances of Reynolds to find F values of Genetic ST Differentiation or Coalescency. The UPGMA algorithm allowed us to express the values F between pairs of ST ethnoses-localities and to carry out the analysis of the main clusters, by means of a tree. RESULTS: The tree exhibit 7 main clusters. Cluster I comprised only the ethnos located to SE of Asia. The American ethnoses are located along the clusters 2 to 7. The less diverse ones were two: the Quechua from Taquile, (Puno-Peru) - 100 per cent B haplotype, and the Kuna from Panama, – 100 per cent A haplotype. CONCLUSIONS: Genetic differentiation larger values were in the Yanomami (0.23741) group. For Peru, they were in the Aymara ethnos from Taquile with F values of 0.16673. Both correspond to a High Genetic Divergence respect to the near closest ones. (AU)^ien.
Descriptores:ADN Mitocondrial
Población Indígena
Filogenia
Grupos Étnicos
Haplotipos
Perú
 Indios Norteamericanos
 Indios Sudamericanos
Límites:Humanos
Masculino
Femenino
Medio Electrónico:http://sisbib.unmsm.edu.pe/BVRevistas/abiola/2008_v14/pdf/a04v14n1.pdf / es
Localización:PE1.1

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Id:PE1.1
Autor:Ramirez, Jorge; Ramírez Mesías, Rina Lastenia; Romero, Pedro; Chumbe, Ana; Ramírez Roca, Pablo Sergio.
Título:Posición evolutiva de caracoles terrestres peruanos (Orthalicidae) entre los Stylommatophora (Mollusca: Gastropoda)^ies / Evolutionary position of Peruvian land snails (Orthalicidae) among Stylommatophora (Mollusca: Gastropoda)
Fuente:Rev. peru. biol;16(1):51-56, ago. 2009. ^bilus, ^btab.
Resumen:Los géneros Bostryx y Scutalus (Orthalicidae: Bulimulinae) son endémicos de América del Sur y están principalmente distribuidos en la vertiente occidental de los Andes del Perú. El objetivo del presente trabajo fue evaluar su posición evolutiva dentro de los gastrópodos Stylommatophora basada en el marcador mitocondrial 16S rRNA. Fueron obtenidas cuatro secuencias las que, junto con 28 de otros Stylommatophora disponibles en el GenBank, fueron alineadas con ClustalX. La reconstrucción filogenética se realizó mediante los métodos de Neighbor-Joining, Máxima Parsimonia, Máxima Verosimilitud e Inferencia Bayesiana. El alineamiento resultó en 371 sitios, con presencia de indels. Los dos géneros de la Familia Orthalicidae por primera vez incluidos en una filogenia molecular (Bostryx y Scutalus), formaron un grupo monofilético con otro miembro de la superfamilia Orthalicoidea (Placostylus), tal como lo obtenido con marcadores nucleares. Se discute también su relación evolutiva con otros caracoles terrestres. (AU)^iesThe genera Bostryx and Scutalus (Orthalicidae: Bulimulinae) are endemics from South America. They are mainly distributed on the western slopes of the Peruvian Andes. The goal of the present work was to assess their evolutionary position among the stylommatophoran gastropods based on the 16S rRNA mitochondrial marker. Four sequences were obtained, and along with 28 sequences of other Stylommatophora retrieved from the GenBank, were aligned with ClustalX. The phylogenetic reconstruction was carried out using the methods of Neighbor-Joining, Maximum Parsimony, Maximum Likelihood and Bayesian inference. The multiple sequence alignment had 371 sites, with indels. The two genera of the family Orthalicidae for the first time included in a molecular phylogeny (Bostryx and Scutalus), formed a monophyletic group along with another member of the superfamily Orthalicoidea (Placostylus), result that is comparable with that obtained with nuclear markers. Their evolutionary relationship with other land snails is also discussed. (AU)^ien.
Descriptores:Caracoles/crecimiento & desarrollo
Gastrópodos/genética
Gastrópodos/crecimiento & desarrollo
Filogenia
ADN Mitocondrial
Perú
Límites:Animales
Medio Electrónico:http://www.scielo.org.pe/pdf/rpb/v16n1/a05v16n1.pdf / es
Localización:PE1.1

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Id:PE1.1
Autor:Sandoval Sandoval, José Raúl; Delgado, Bedsabé; Rivas, Luis; Bonilla, Bertha; Nugent Seminario, Daniel; Fujita Alarcón, Ricardo.
Título:Variantes del ADNmt en isleños del lago Titicaca: máxima frecuencia del haplotipo B1 y evidencia de efecto fundador^ies / Variants of DNAmt among islanders of the lake Titicaca: Highest frequency of haplotype B1 and evidence of founder effect
Fuente:Rev. peru. biol;11(2):161-168, jul.-dic. 2004. ^bilus.
Resumen:Los polimorfismos del ADN mitocondrial son herramientas en el estudio comparativo de poblaciones modernas y antiguas. Entre los más usados están los haplotipos mitocondriales basados en RFLP (polimorfismo de longitud de fragmentos de restricción) y un sistema de inserción/delección. El presente estudio establece la frecuencia de estos haplotipos y compara un total de 144 individuos representativos de las islas Taquile y Amantaní (lengua quechua) y de las islas de Los Uros y Anapia (lengua aymara) del lago Titicaca, Perú. Nuestros resultados revelan la predominancia del haplotipo B1: 100 por ciento en Taquile (n=57); 88,6 por ciento en Amantaní (n=35); 75 por ciento en Los Uros (n=28) y 87,5 por ciento en Anapia (n=24), siendo las frecuencias más altas registradas en el mundo. Otros haplotipos se observan en menor proporción: 17,9 por ciento de A2 y 7,1 por ciento de D1 en Los Uros; 11,4 por ciento de la variante C1 en Amantaní; 4,2 por ciento de cada haplotipo C1, C2 y D1 en Anapia. La alta frecuencia de B1 indica que las poblaciones de Taquile, Amantaní y Anapia provienen de un grupo fundador reducido. Aunque hay afinidad entre las poblaciones aymaras de Anapia y Los Uros; la proporción de algunos alelos en los últimos, sugiere la persistencia de una acervo genético uru en contraposición a la idea de su extinción. (AU)^ies.
Descriptores:ADN Mitocondrial
Polimorfismo de Longitud del Fragmento de Restricción
Haplotipos
Límites:Humanos
Medio Electrónico:http://www.scielo.org.pe/pdf/rpb/v11n2/v11n2a08.pdf / es
Localización:PE1.1

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Id:PE1.1
Autor:Scotto Espinoza, Carlos; Valdivia R., Ricardo.
Título:Sistema mitocondrial animal (SISMIT): un programa de computación aplicado en el análisis molecular de los genomas mitocondriales de animales vertebrados^ies / Animal mitochondrial system (SISMIT): a computing software based in the molecular analysis of mitochondrial genomes of vertebrates
Fuente:Rev. peru. biol;7(1):74-82, ene.-jun. 2000. .
Resumen:El presente trabajo reporta el diseño de un programa de computación que analiza a nivel molecular las secuencias del DNA mitocondrial de 37 animales vertebrados domésticos y silvestres de importancia zoogenética. (AU)^ies.
Descriptores:ADN Mitocondrial
Programas Informáticos
Reacción en Cadena de la Polimerasa
Polimorfismo de Longitud del Fragmento de Restricción
Localización:PE1.1

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Id:PE1.1
Autor:Scotto Espinoza, Carlos.
Título:Análisis filogenético comparativo entre secuencias codificadoras (Cyt b y ATPasa 8) y secuencias no codificadoras (D-Loop) del ADN mitocondrial de primates y sus implicancias evolutivas en los homínidos^ies / Phylogenetic analysis comparing coding (Cyt b and ATPase 8) and noncoding (D-Loop) sequences of primate mitochondrial dna. Evolutionary consequences in hominids
Fuente:Horiz. méd. (Impresa);6(2):111-129, jul.-dic. 2006. ^bilus, ^btab, ^bgraf.
Resumen:Las secuencias del ADN mitocondrial (ADNmt) de animales vertebrados han sido estudiadas desde hace 25 años. Sólo ahora se cuenta con el genoma mitocondrial completo de muchas especies para hacer un análisis más detallado de cómo evolucionan sus secuencias y como esto influye en la construcción de árboles filogenéticos con la aplicación de los diferentes modelos matemáticos y programas bioinformáticos. En definitiva, aún existe un recurrente debate evolutivo acerca de cuáles secuencias mitocondriales son las más adecuadas de utilizar para explicar mejor los procesos que operan dentro de las especies animales. Por lo tanto, el presente trabajo se propone analizar todas las posibles alternativas de solución utilizando tanto secuencias mitocondriales nucleotídicas como aminoacídicas. (AU)^iesMitochondrial DNA (mtDNA) sequences of vertebrates have been studied for 25 years. Now, we have complete sequences of mitochondrial genomes of many species and this allows a more detailed analysis on the evolution of these sequences and how this influences the construction of phylogenetic trees with the application of different mathematical models and bioinformatics programs. Definitely, an old evolutionary discussion has come back about which mitochondrial sequences are the most appropriate to use in order to explain the processes operating within animal species. Therefore, the aim of this paper is to analyze all these possible alternatives using mitochondrial nucleotide and amino acid sequences. (AU)^ien.
Descriptores:Filogenia
ADN Mitocondrial
Análisis de Secuencia de ADN
Primates
Evolución Biológica
Hominidae
Medio Electrónico:http://www.medicina.usmp.edu.pe/horizonte/2006_II/Art8_Vol6_N2.pdf / es
Localización:PE1.1

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Id:PE14.2
Autor:Yánez Vallejo, Pamela Katherine; Mamani Zapana, Enrique Walter; Valle Toledo, Jorge; García Mendoza, María Paquita; León Cueto, Walter Gustavo Rafael; Villaseca Castro, Pablo Edilberto; Torres Gonzales, Dina; Cabezas Sánchez, César Augusto.
Título:Variabilidad genética del Aedes aegypti determinada mediante el análisis del gen mitocondrial ND4 en once áreas endémicas para dengue en el Perú^ies / Genetic variability of Aedes aegypti determined by mitochondrial gene ND4 analysis in eleven endemic areas for dengue in Peru
Fuente:Rev. peru. med. exp. salud publica;30(2):246-250, abr.- jun. 2013. ^btab, ^bgraf.
Resumen:Con el objetivo de establecer la variabilidad genética de Aedes aegypti determinada por el análisis del gen mitocondrial ND4, se analizaron 51 especímenes de Ae. aegypti en once regiones endémicas para dengue en el Perú. La variabilidad genética se determinó mediante la amplificación y secuenciación de un fragmento de 336 pares de bases del gen mitocondrial ND4. El análisis de filogenia intraespecífica se realizó con el programa Network Ver. 4.6.10; y el análisis filogenético, con el método de distancia Neighbor Joining. Se identificó la presencia de cinco haplotipos de Ae. aegypti agrupados en dos linajes: el primero agrupa a los haplotipos 1, 3 y 5 y el segundo agrupa los haplotipos 2 y 4, se muestra además la distribución geográfica de cada uno de los haplotipos encontrados. Se concluye que esta variabilidad se debe tanto a la migración activa de este vector como a la migración pasiva mediada por la actividad humana. (AU)^iesIn order to establish the genetic variability of Aedes aegypti determined by the analysis of the MT-ND4 gene, in eleven endemic regions for dengue in Peru, 51 samples of Ae. Aegypti were tested. The genetic variability was determined through the amplification and sequencing of a fragment of 336 base-pairs of MT ND4, the analysis of intra-specific phylogeny was conducted with the Network Ver. 4.6.10 program; and the phylogenetic analysis, with the Neighbor Joining distance method. The presence of five haplotypes of Ae. Aegypti grouped in two lineages was identified: the first one includes haplotypes 1, 3 and 5, and the second one comprises haplotypes 2 and 4. The geographic distribution of each of the haplotypes found is also shown. It is concluded that this variability is caused by the active migration of this vector and the human activity-mediated passive migration. (AU)^ien.
Descriptores:Aedes/genética
Haplotipos
Linaje
ADN Mitocondrial
Perú
 Estudios Transversales
Límites:Animales
Medio Electrónico:http://www.ins.gob.pe/insvirtual/images/artrevista/pdf/rpmesp2013.v30.n2.a14.pdf / es
Localización:PE14.1; PE1.1



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